明万历三十二年公元1604年正月18日，在帝都京城内发生一件浩浩荡荡的大喜事，乃是大明神宗万历显皇帝：朱翊钧，皇三子明福恭亲王：朱常洵，举行的成亲仪式。
此次礼节规模庞大，明神宗还特意从户部开出30万两黄金，专门用来筹办这场隆重的婚礼。
席间最先到达的除了明神宗与明王皇后：王淑蓉，其次就是明皇太子：朱常洛，与各大附属国使者、都指挥使、总镇总兵、六部尚书、都察院等文武官员们皆来祝贺。
这次明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，也发来贺礼，就连诸位亲王也率先敢来，郡王们纷纷把贺品交由礼部就这样明福恭亲王与明恭亲王妃：郭青雪，就在京城举行婚礼。
6月11日，京畿顺天府昌平州大雨，浸坏了宗庙；明成祖燕王永乐文皇帝：朱棣，的「长陵」、明孝宗弘治敬皇帝：朱佑樘，的〈泰陵〉、明武宗正德毅皇帝：朱厚照，的（康陵）、明穆宗裕王隆庆庄皇帝：朱载垕，的［昭陵］，导致石渠及陵墙开裂。
至7月初1日，京城各地又连降大雨，续两月不止，外城正阳门、崇文门一带，城垣中陷者七十余丈，民居多坏。
明神宗遂发太仓库银十万两救济被水淹居户，而永平府、保定府、真定府各州县亦大雨不止，溺死男女无数。
9月10日，明户部尚书：赵世卿，奏报称“各镇下半年年例通该给发银一百五十七万八千余两，今查本库实在各项只有四千五百六十五两，无从给发，乞借发老库银若干，马价银若干。”
于是明神宗下诏借支太仓库银二十万两、太仆寺银三十万两，作速解边，以济边镇之急，待日后有余时，务补足归还。
9月20日，明楚亲王：朱华奎，贿赂明内阁首辅兼东阁大学士：沈一贯，让通政司不报明楚亲王府镇国将军：朱华积，奏报的伪楚子嗣案件，指；现任明楚亲王：朱华奎，与其弟明宣化郡王：朱华壁，俱不属于明楚恭亲王：朱英?，所生子嗣。
因为明楚亲王：朱华奎，是明楚恭亲王妃：王兰英，的哥哥：王如言，侍妾：尤金梅，所生的儿子。
而明宣化郡王：朱华壁，则是明楚恭亲王妃族人：王如綍，的家人：王玉，的儿子，两人都是在出生数月后，被抱到楚亲王府中抚养。
这种说法得到了楚藩宗室明东安郡王：朱英燧、明武冈郡王：朱华增，等多人的支持，由此引发了一场旷日持久的楚亲王血统之争，朝廷对宗室血统出现混乱极为重视，处罚极其严厉。
毕竟当年汉亲王府就曾发生过，抱养异姓人，用来冒充宗室子弟的恶例，使得已故明汉阴恭怀郡王：朱征鍉，被废为庶人，明汉阴郡王母妃：平倩、明汉阴郡王妃：周文秀，以及冒封的明汉阴郡王：朱偕汪、明安良县主：朱凤兮，均遭斩杀。
首犯明汉阴郡王岳父：周恂，被凌迟处死，妻妾子女都被杀了头，受牵连之人都被斩杀、流放。
包括晋亲王府也被曝光了类似的事件，因明镇国将军：朱锺鏕，无嗣，于是与夫人：张氏、岳父：张瑁、岳母：孙氏，合谋找了张氏怀孕的弟媳妇入府产子，用来冒称自己的儿子。
同出自晋王藩系的明方山郡王：朱锺铤，也为他们遮掩，在成功诞下男婴之后，奏请朝廷为这个男孩赐名为（朱奇漺），并授予封爵。
同时明方山郡王也被告发其他各种不法行为，使得明方山郡王被废并通报批评，朱锺鏕被削封号之后，张瑁夫妇便被处斩，朱奇漺则被赐自尽。
因而反被判以诬告罪，使得楚亲王府宗人们皆不服，俱称楚亲王伪迹昭着，行贿有据。
还上京告御状，可明神宗非但不听，还下旨切责诸楚亲王府宗人们罚禄削爵。
之后明楚亲王又献银一万两资助大兴土木，但诸楚藩宗室疑其输贿？特意渡江拦劫，明湖广总镇巡抚：赵可怀，令有司抓捕治理楚藩宗室。
使得楚藩宗室怀恨赵巡抚治狱不公，故意庇护楚亲王殿下。
9月24日，楚藩宗室们集结了数百人，各自持刀闯入湖广总镇巡抚衙门内，当场杀死赵巡抚，一时间人心汹涌，官员纷纷逃避，惟独明湖广布政司右参政：薛三才，与明湖广提刑按察使：李焘，坚守岗位。
再由明湖广总镇巡按：吴楷，向朝廷宣告楚藩宗室叛变消息。?
事后明神宗急命南镇抚司锦衣卫提骑逮捕诸楚藩宗室，共有七十三人坐狱问罪，成为当时轰动远近的大案。
同时将为首的楚藩宗室：朱蕴钤、朱蕴鍧，处斩，赐朱华堆等三人自尽，朱华嫶等二十三人禁锢狱中，朱蕴钫等二十二人革职闲住，朱蕴鎏等十八人降爵革禄，并停其待封者。
明万历三十三年公元1605年，尼德兰王国（荷兰）何属东印度公司入侵大明帝国福建承宣布政使司台湾府澎湖巡检司，并伐木建房还派大明商人：李锦、郭震，向地方官上报大明天子准备通商的消息。
当即被拒绝，明福建总镇巡抚兼都察院右佥都御史：徐学聚，下令禁止渔民下海，断了尼德兰人经济，导致尼德兰人被迫撤走，之后又反攻台湾府夺取了澎湖巡检司开始设防。
4月27日，明神宗命明通政司右通政：陈子贞，等十二人为正使、明中书舍人：庄元臣，等十二人为副使，册封周王系宗人：朱在錝，为奉新郡王、朱勤煘，为义阳郡王、朱在壑，为安吉康和郡王。
册封益王系宗人：朱由棅，为安仁郡王，册封荣王系宗人：朱载珁，为贵溪郡王，册封鲁王系宗人：朱寿锳，为东原郡王、朱以浩，为安丘郡王、朱寿碒，为邹平郡王。
册封楚王系宗人：朱盛浮，为通城郡王，册封蜀王系宗人：朱奉??，为南川郡王，册封沈王系宗人：朱效鑍，为保定郡王、朱效鋞，为沁水郡王。
册封秦王系宗人：朱谊侃，为永寿康裕郡王，册封晋王系宗人：朱敏淴，为河东郡王，册封辽王系宗人：朱术??，为蕲水郡王。
此时陕西行都指挥使司的明军警报响起，边界已经有5年没打仗了，由漠南蒙古土默特部首领：银定，和漠南蒙古西土默特部首领：歹成，一起发兵攻打大明帝国陕西行都指挥使司镇番卫被明陕西总镇总兵兼陕西都指挥佥事：柴国柱，打败退去。
9月25日申时，京师发生小规模地震，自东北向西南行，连震二次。
此时京军三大营官军前往京师内城盔甲厂领取盔甲火 药，而监放火 药的明兵仗局掌印太监：臧朝、明提督军器库太监：王才，因坛内旧火 药已结成硬块，不便分发！
就命令工匠用铁斧劈开，结果造成爆炸，声若雷霆，火枪、火箭进射百步之外，烧死明兵仗局掌印太监以及明五军营把总：傅钟，等十人、明神机营把司：李仲保，等八十三人。
其局内工匠人等并街市经过居民死伤者多不可稽，焚毁明时坊五处！
11月14日，明皇太子才人：王瑶英，成功诞下明皇长孙：朱由校，但其地位却依旧不受待见！
12月初1日，自万历二十四年设矿监税使以来，廷臣们上疏谏阻者不下百余次，但明神宗俱不听，以致于矿监税使四出，大肆虐民，流毒全国，结果是民穷财竭，各地骚动暴乱。
而万历二十五年至万历三十三年近十年间，各矿监所进矿银不足三百万两，至于不计其数的金珠、宝玩、貂皮、名马则俱为大明天子所有。
导致内阁大臣们再次极论矿税害民状，又言“开矿破坏天下名山大川，尽伤灵气，恐对陛下身体大为不利，只有急停开矿，灵气才能恢复。”
为此明神宗于12月初2日，下诏罢天下矿税，以税务归有司，以岁输所入的一半归于内府，另一半归户、工二部，时称“停矿分税”。
然而矿监税使们却并没有撤回来，其害一直延续到明神宗病死，方告结束。
明万历三十四年公元1606年正月24日，由于明神宗下诏罢免全国矿税，所以遭到平时获利的矿监税使们的反抗，明陕西税监矿使：梁永，不仅坚持不撤陕西承宣布政使司咸阳县、陕西都指挥使司潼关卫，两地的税役，且纠集无赖纵横苛征，渔肉百姓，滥捕无辜百姓数十人，横加拷掠，勒索民财，致使人心惶惶。
因此明陕西总镇巡抚兼都察院右副都御史：顾其志，为平民愤，将首要分子明陕西税监右少监：王遇义，等人依法治罪，让明陕西税监矿使大为恼恨，伺机报复。
此时其党咸阳县百姓：胡奉因，与明咸阳县知县：陈时济，积有私怨，即唆使明陕西税监矿使令取咸阳县绒毡一千五百件，价值计银四千两。
因而被明咸阳县知县给拒绝，怒而不给，被明陕西税监矿使诬告明咸阳县知县抗旨劫税，遭到明神宗下令逮捕明咸阳县知县！
2月11日，由于明皇三子福亲王：朱常洵，出生时即封其生母明郑贵妃：郑妙瑾，为皇贵妃，而对明皇长子：朱常洛，之生母明恭妃：王淑蓉，却迟迟不依廷臣之请进封为皇贵妃。
在未立皇太子之时，此事曾引起种种猜测，闹得满城风雨，现在明神宗刚刚觉悟开始进封明恭妃为皇贵妃。
3月初6日，明云南税监矿使：杨荣，长期恣行威福，破坏祖宗制度，奏开宝井，又胁迫当地土司献地开矿，致使边境不安，外夷乘机用兵，犯我边民。
被明云南总镇巡按：宋兴祖，上疏弹劾，但明神宗却不理，使得明云南税监矿使由是怙宠益横，也让云南承宣布政使司各族人民无不恨之入骨，首先由腾越州人民发起暴动。