即使江西省政府仍以南昌为省会，复兴会的重心仍在九江。复兴会总部、左七军军部、右二军军部、中兴公司总部等重要机构都设在九江。
结束南昌之行后，吴捷一回到九江，便指示在全党、全军、江西省府推动一场声势浩大的整风运动。
吴捷之所以急于推动整风运动，主要有三方面的考虑。
第一，复兴会骤然占领江西全境，尚未完全消化吸收。境内还残存着大量的封建残余，省府亦留用了大量的旧官僚。
之前战事发展太快，复兴会大量吸收新会员，左七军、右二军也留用了不少湘军、绿营军官。由于时间仓促，复兴会来不及仔细甄别，导致各级机构混入了不少异类分子。
复兴会对新会员的教育不够深入持久，不少人还存留着大量的投机心理、自由主义倾向，对复兴的组织性、纪律性认识不足。
种种弊端，从诸多迹象中都能窥见一二。
如，前任巡抚文俊在老百姓中尚有较大威望，能够轻易斥退轿夫。如，南昌士绅当场请吴捷为章江门改名、题字，背后似有小人作崇。再如，在个别地方，有些恶吏把持乡政府，政令竟然难以下达。
第二，反对各种不良现象。
随着复兴会对江西全境的占领，复兴会、省政府、左七军、右二军都迅速膨胀，个别老干部居功自傲，个别组织出现腐化现象。
复兴会才占领一省，就出现诸多不良现象。若占了天京，岂不又要像李自成、像洪秀全杨秀清那样迅速腐化？
必须未雨绸缪，展开一场强有力的运动，清除复兴会中的不良现象，始终保持复兴会的纯洁性、纪律性、战斗性。
第三，如今已是8月上旬，太平天国天京事变即将爆发。届时，吴捷将率军前往天京靖难。在此之前，必须建立稳固的后方，防止后院起火。
按照职责，发动整风运动显然要由政工部部长李云牵头负责。但整风运动势必要得罪人，李云又是女性，已经怀有身孕，显然不便当此重任。
吴捷把这个任务交给了政工部副部长李珊元。李珊元兼有敌工处处长的职务，欣然受命。
让敌工处处长在自己人中间推行整风运动，似乎并不合适。但时间紧迫，吴捷也不及提拔、培养新人，还是让李珊元主持其事。
为郑重其见，吴捷指示成立一个整风工作小组，自己亲任组长。李珊元以政工部副部长的身份担任小组副组长。
熟悉复兴会的人也凛然意识到：李珊元全面主持对敌工作，谁不支持整风运动，谁就将是复兴会的敌人！
吴捷亲自主持整风运动，由李珊元具体督促落实。
首先，明确整风运动的目的是什么？主要有三个：
一要建强复兴会各级支部，确保复兴会的集中统一领导。
复兴会的人数并不多，却能在短短三年内脱颖而出，夺占江西全境，取得举世瞩目的成就。归根结底，主要在于复兴会是一个团结如铁的、人才济济的先进政党。
太平军能够以弱胜强，在清军重重包围之中保持扩张态势，很大一部分原因在于杨秀清大权独揽，能够调集所有的资源对付清军。
天地会遍布华夏，会众不下数百万，自清初便起义不断，却屡屡碰壁，毫无成就。这与天地会组织涣散，缺少集中统一领导关系很大。
复兴会的事业不会止步于江西。她将打败更多的敌人，占领更大的地方，统治更多的人口。为此，必须坚定不移地建强各级复兴会支部。
二要统一全会思想，消除会内杂音。
必要的争执、讨论是有益于发扬民主，有益于团结一致，有益于集思广益的。但是，复兴会的领袖只有一个，那就是吴捷。复兴会的纲领也只有一个，是全会所有人员都要坚定奉行、坚决维护的。
只要是复兴会总部通过的决议，下级支部、各个会员都要无条件的遵守、无条件的奉行。若有意见建议，要通过正常渠道，通过合法程序向上反映，不应发出牢骚怪话，影响团结。
例如，复兴会总部决定推行简体汉字、英语拼音。这有利于扫除文盲，有利于普及义务教育，有利于保障全体国民的受教育权利。
有人认为此举会破坏华夏传统文化，甚至攻击这是“以夷变夏”。也有人主张全盘西化，废除汉字，使用英语作为官方语言。
这些看法显然都是错误的。既然总部已经决定要推行简化汉字、英语拼音，各级支部都应鼎力支持，坚决贯彻落实，不能畏难不办，更不能牢骚怪话一大堆。
三要克服宗派山头，保持团结如一。
复兴会壮大了，会员人数增加了，但会内也隐然出现了若干山头，影响全会团结。
例如，吴捷刚开始发迹时，部下多为湖南人。这些湖南人把自己视为“从龙之臣”，在左七军中势力很大。
很多团、营主官都是湖南人。这些湖南军官刻意与湘军降将交好，引起左七军中其他籍贯的战将的不满。
宗派山头的存在不利于军令政令的统一，也不利于复兴会的团结统一，必须坚决消灭之。
整风运动需要把握的重点是什么呢？吴捷认为主要在于以下四个方面：
一要掌握正确的方式方法。
历史经验表明，此类运动容易搞过头，容易伤及无辜，容易扩大打击面。若掌握不了正确的方式方法，很容易反噬自己，造成难以挽回的损失。
为此，吴捷特意强调，决不能滥杀无辜，决不能借机打击异己，决不能压制正确意见建议。
若在整风运动中发现犯罪问题，必须移交法院，经法院审判、律师辩护后，方能定罪。
为防止运动过火，整风运动领导小组会派出巡视小组，对开展运动的军队、政府、学校进行巡视，及时纠偏纠错。
若有人认为组织处置不公，可以向上级组织申诉，也可以向巡视小组反应问题。
二要坚持惩前毖后、治病救人的总基调，不扩大打击面。
吴捷强调，大部分的复兴会支部组织和会员都是好的，不存在大的错误、问题。对于运动中发现的犯了错误的组织和个人，要坚持惩戒与教育相结合，帮助同志认清错误、积极纠正错误。
对待可能犯错的同志，不能含糊敷衍，不能似是而非，对就是对，错就是错，不能让同志带着思想包袱干工作。
处理犯了错误的个人，要慎之又慎，小错以教育帮带为主，大错要移交司法机关，经法院审判后方可定罪。
复兴会乃是一个新兴政党，大多数会员都是最近一年新加入的，对复兴会的信仰还不够坚定。因此，吴捷认为，会员犯错应以宽大为主，只要不是原则性的问题，只要不触及犯罪，都应在组织内部解决。
三要区分试点、推开、总结三个阶段，由浅入深开展整风运动。
复兴会从未开展过类似的运动，在这方面缺少经验，不能盲目盲干，一下子就在全会铺开。
首先，要在复兴会总部开展试点，总结经验，探索方法路子。
其次，经过试点，总结试点经验后，在左七军、右二军、省政府逐渐铺开。之后，再在市以下政府、法院、咨政局、中兴公司、学校等外围组织内推开。
最后，全面总结经验，形成运动成果。
四要结合运动，及时总结经验，建立长效机制。
吴捷认为，要优先建立干部档案制度、民主生活会制度、监察制度、思想教育制度。
要借助整风运动，清查干部背景，了解干部履历，制定干部档案。档案由上级负责管理，是复兴会使用管理干部的重要依据。
要建立民主生活会制度，定期开展批评与自我批评，发扬民主，团结同志。
要建立监察制度，对腐败贪污、徇私枉法等行为展开斗争。各级支部应建立监察委员会，人数过少的支部，可设置一名监察委员。
要建立思想教育制度。各级支部委员会负有教育会员的职责，需定期开展思想教育，要求会员定期汇报思想。
历史上，延安整风是一场伟大的思想解放运动，为我党夺取天下奠定了重要的思想基础。
吴捷期待此次整风能够发挥类似的作用，最起码可以为他巩固江西根据地，进而帮助他入主天京。