随后幕府第二军右副将也快马加鞭赶赴咸镜南道咸兴府北清都护府，又率先在咸镜北道镜城都护府遭遇到了李氏朝鲜边防步骑兵的攻击。
一开始幕府第二军右副将：加藤清正，被李氏朝鲜咸镜北道兵马节度使：韩克诚，率领的专门防御女真各部精锐步骑兵给打败，退到了海汀仓。
本来形势对于李氏朝鲜咸镜北道的步骑兵来说非常有利，但是李氏朝鲜咸镜北道兵马节度使却不听从麾下部将们的劝告，不进行修整，反而想一鼓作气全歼灭这支来犯的幕府军队。
结果就被幕府第二军用火绳枪反攻，遭到了失败损失惨重！还生擒了李氏朝鲜咸镜北道兵马节度使。
后来李氏朝鲜咸镜北道吉州郡评事：郑文孚，在镜城都护府境内招募义军，组装起武装力量用来反抗幕府倭寇第二军，其麾下的骑兵部队在吉州镇「下德山之战」中，李氏朝鲜咸镜北道吉州郡评事用义军骑兵冲垮了幕府倭寇第二军的铁炮部队。
又在吉州镇「双浦之战」，再次用义军骑兵击败了幕府倭寇第二军的步兵与火绳枪队。
不过幕府第二军右副将却在咸镜北道会宁镇，意外的遇到了，刚刚招揽了一小股李氏朝鲜军队的，李氏朝鲜庶长子临海大君：李珒、庶六子顺和大君：李??，当场就派遣军队包围起来俘虏了两位王子。
本以为幕府第二军右副将要杀害他俩，但他却出乎意料的说了一句“大和语：我国乃是仁义之邦，富有仁爱之心，从来不妄杀投降者，还请两位王子不必担忧，定会好生招待。”
之后幕府第二军右副将就感觉，李氏朝鲜王国的平定已成定局，便命随军的僧侣起草告示，写道；示谕境内之黎民及鳏寡孤独，仆奉吾殿下之命，抚当境，要除苛政。而布善政，救民于涂炭，速还旧居，以修家业，勿疑勿疑，又呈示境内之文物官僚，奉吾殿下之命，安抚此境内，仆虽不敏，要布善政于境内，各还本宅，以精武艺，则必应其器以授职矣，先服者赏之，不服者削之请计之。
从这段话可以看出幕府倭寇军队，曾经出于久据李氏朝鲜王国为目地，而维持过严格的军纪。
随即幕府第二军就把咸境南北道的经略任务，交付给了安土桃山幕府左卫门大夫：锅岛直茂，自己则亲率精兵五千人渡过了图门江，成了〈壬辰倭乱〉当中唯一一个入侵大明帝国境内的幕府军将领。
此刻到达李氏朝鲜王国与大明帝国边境，平安西道义州郡的李氏朝鲜宣祖昭敬郡王河城大君：李昖，开始遣使跨过辽东都指挥使司向宗主国大明求援。
当时李氏朝鲜王国八道已失六道，仅剩下江原东西道尚未被完全统一，而全罗左右道则处于被幕府倭寇入侵的状态，乃至抗击倭寇的僵持当中。
也让李氏朝鲜郡王清楚的认识到了，若没有得到大明帝国的帮助，恐怕根本就不可能在光复李氏朝鲜王国了！因此便派遣了几批使臣相继前去辽东都指挥使司向大明帝国求救。
李氏朝鲜王国北逃的使臣们，除了向大明神宗万历显皇帝陛下：朱翊钧，递交正式的国书外，还分别前去游说大明帝国的内阁群臣、六部尚书、六部侍郎、都察院各部御史、内廷十二监宦官，甚至表示愿意内附于大明帝国，想以此来促使大明皇帝尽快出兵救援李氏朝鲜王国。
5月29日，李氏朝鲜全罗左道水军节度使：李舜臣、李氏朝鲜全罗右道水军节度使：李亿祺、李氏朝鲜尚庆右道水军节度使：元均，再次出海以「龟船」为主引诱安土桃山幕府第五军水师来岛康亲：来岛通总，在〈泗川海战〉利用涨潮拖住倭寇将其歼灭。
并成功斩杀了幕府第五军水师来岛康亲。
6月初3日，幕府关白：丰臣秀吉，制定了征服李氏朝鲜王国以及大明帝国的计划有二十五条，其中几条为；李氏朝鲜王国都城已于五月初九日攻克，所以近期内吾将迅速渡海……此次如能席卷大明，当以唐帝国，指（大明帝国）关白之职授汝，指（丰自己的侄子安土桃山幕府清洲城主：丰臣秀次）以京城百国之地封汝，宜准备奉圣驾天皇陛下于大唐之京城，可于后年行幸，届时将以京城附近十国，作为圣上之领地，诸公卿之俸禄亦将增加，其中下位者将增加十倍，上位者将视其人物地位而增，至于幕府关白一职，将视大和中纳言与备前丞相二人情况，择任之。
同时还下达了攻打大明帝国的军令，三路幕府军队限期入辽东都指挥使司拿下明帝国帝都北直隶顺天府紫禁城。
6月13日，明甘肃总镇巡抚兼都察院左都御史：叶梦熊，从陕西行都指挥使司甘肃总镇调运去有；青铜弗朗基流星炮、百子连珠炮、飞云霹雳炮、轰天霹雳猛火炮、毒募神烟炮、八面旋风吐雾轰雷炮、神烟炮、神威大炮、九矢钻心炮、千子雷炮、无敌大将军炮，等轻重型火炮。
以及；单眼铳、双眼铳、三眼神铳、四眼神铳、五雷神铳、八眼神铳、十眼神铳、十方铳、迅雷铳、连珠铳、拐子铳、鸟铳，等火器一共四百车，又征调了各地都指挥使司苗兵。
明浙江巡抚兼都察院右副都御史：常居敬，还招募了浙兵三千八百余人，自备粮饷赶赴救援。
很快诸堡次第被收复，惟有宁夏卫总镇（宁夏卫、宁夏前卫、宁夏左屯卫、宁夏右屯卫、宁夏中屯卫）五卫屡攻不克！
于是官兵便分为五路逼近城下，明宁夏卫总镇监军副使：梅国桢、明陕西提督：李如松，统率辽东都指挥使司铁骑、万全都指挥使司宣府镇宣府三卫军队、山西行都指挥使司大同府四卫军队包围过去军势大振。
6月15日，再一次攻城，依旧连战不下，起初，明陕西三边总督：魏学曾，遣人招降叛军宁夏卫总镇总兵：刘东旸、叛军宁夏卫总镇右副总兵：许朝，曾在平凉府固原州固原卫总镇停留了十余日等待消息。
就被明宁夏卫总镇监军副使给弹劾，明神宗当即下令责备他玩忽职守，恰好明固原卫总镇副总兵：李昫，渡过黄河又迟了点，导致河套部袄儿都指挥使司的叛军先进入，让明军再次作战失利。
这让明陕西三边总督很是生气，就上疏朝廷要求明宁夏卫总镇监军副使不要参与兵事，而明神宗就命令明宁夏卫总镇监军副使遵守这一点，但明宁夏卫总镇监军副使却颇为不满意。
等明陕西三边总督来到中军帐之后，明宁夏卫总镇监军副使立刻，就在诸将面前指责他的过失，诸将们则观望不定，只能任由明宁夏卫总镇监军副使上奏弹劾明陕西三边总督坐实玩忽职守之罪。
此刻安土桃山幕府倭寇正规军对李氏朝鲜王国的大举入侵，深深地震惊了整个大明帝国朝廷，如今朝堂内外的群臣们纷纷商议要不要出兵去援助李氏朝鲜王国，而争论不休。
因当年沿海长达一百多年的倭患，几乎让所有人都非常的很痛恨倭寇和浪人，但倭寇的凶狠与顽强，大明君臣们也是有所耳闻的，现在大批侵朝幕府军队全都是正规军，战力远非当年的倭寇可比。
况且大明帝国在「庚戌之变」之后的几十年里，从未面临过如此大规模的战争，能否战胜侵朝幕府大军，让大明君臣们实在没有太大把握。
不过安土桃山幕府关白：丰臣秀吉，让琉球中山王国，臣服幕府萨摩藩朝贡的消息传来，更是彻底的激怒了大明君臣，再加上这次的吞并李氏朝鲜王国战机，已经让大明帝国上下实实在在的感受到了这个倭寇蛮人的野心。
况且大明君臣们早已习惯了，以自己为天朝上国的地位，古语云“卧榻之侧，岂容他人酣睡？”
再则从明神宗：朱翊钧，的角度来看，他自然也绝不能容忍安土桃山幕府，这个曾经朝贡过大明帝国的附属国如此嚣张。
又遇上明兵部左侍郎兼都察院右都御史：宋应昌，在上疏中说道“关白之图李氏朝鲜王国，其意是在谋夺华夏，吾国救李氏朝鲜王国，非止为保附属国也，若李氏朝鲜王国固，则东保辽东都指挥使司与京师巩固于泰山矣，而我军之救李氏朝鲜王国实为保我大明也。”
这种观点在当时有一定的代表性，大明朝廷上下官员们基本都达成了迎敌于外，毋使入境的共识。
但在询问李氏朝鲜王国使臣，倭寇正规军到底有多少人之时？却发现众人都是一问三不知？有些人则说有几千？有些人则说有几万？就这样让大明官员们觉得这些人都是智障，便决定自己先派兵前去查看情况。
6月25日，明军用布袋三万个，盛土用来堆积城墙登城，明大同总镇总兵：麻贵，又率先提议道“三边总督大人，咱们光是围城，恐怕不能够逼迫叛军们出来吧？何不利用黄河之水往城里灌城，水淹叛军，让他们失去外援。”
此计立刻被明陕西三边总督给采纳了，明军们开始乘势环城筑堤一千七百丈，决定用黄河之水灌城，并打算击退城外河套部蒙古援军，让城中缺粮，在逼叛军宁夏王：哱拜，投降。
6月28日，经过朝廷商议，兵部决定让辽东都指挥使司出兵救援，派出了明辽东总镇副总兵：祖承训，带领5千人马入李氏朝鲜王国作战。
7月初3日，明陕西三边总督决定在众将面前立威，便夸下海口定能剿灭叛军俯首称臣，明甘肃总镇巡抚：叶梦熊，听后就向朝廷上奏赐他「尚方宝剑」。
随后明甘肃总镇巡抚、明陕西三边总督、明宁夏卫总镇监军副使，三人定下计策来，下令挖开黄河大坝之水灌城，水流迅速到达城下。