并传令免去在京升任授官的面谢礼，此后明神宗：朱翊钧，视朝次数越来越少！
3月16日因云南承宣布政使司永昌军民府一带，之前招募了川、楚、粤，三处亡命之徒为兵，分立在腾冲卫、姚安中屯守御千户所两营。
以明大理府副总兵：刘綎，统领腾冲卫军营，明楚雄府副总兵：邓子龙，统领姚安中屯守御千户所军营。
由于结果两营主帅持功骄傲不服对方，再加上管理范围有冲突，导致两营发生斗殴事件，地方官员上报朝廷明神宗又因二将皆有功而视之不见。
仅仅只是把刘副总兵调走，换了明永昌军民府副总兵：刘天俸，上任他本人属于地方土司血统再加上性格暴躁，经常放纵士兵欺负百姓被抓。
于是就让明楚雄府副总兵：邓子龙，来兼管两营，但明楚雄府副总兵却偏袒自己的老部下姚安中屯守御千户所军营，苦的累的活都让腾冲卫军营来做。
吃饭的时候姚安中屯守御千户所军营的膳食，更是腾冲卫军营的两倍，结果导致姚安中屯守御千户所军营养成了骄奢的习惯，因索要军饷不成而造反，叛军毕竟是职业军人，所以战斗力极其强大。
他们在教场上面树起大旗，杀掠居民，抢夺马匹，声称要赏银，并聚众一路往西杀入永昌军民府永平县因城门尽闭不得入，再加上大理府大罗卫、洱海卫，两处明军追击而来，迫使叛军转入大理府太和县，沿途剽掠军民。
消息很快就引得明黔国公兼太子太保：沐昌祚，明云南巡抚兼都察院右佥都御史：萧彦，一起督兵夹击斩杀八十四人，俘获六百八十人，叛军不得已诈降，败逃云南府安宁州、武定军民府、姚安军民总管府。
4月初7日广东承宣布政使司南雄府始兴县僧人：李圆朗，在朔源村下洞水宝庆庵内造妖书，煽动人心，言有易死还生，先天演禽及剪纸为人马之术。
夜间则飞动并飞劫杀人诸秘法，诡称韶州府翁源县人：王子龙，为齐冲天将军兼金统帝：黄巢，之后，有金统帝遗产十二窑，愿从者可瓜分之。
又称王子龙乃弥勒降生，子丑年天有大灾，鬼将食人，捐资自投者给米符可免。
就这样经过一番舆论准备之后，妖僧：李圆朗，就与王子龙聚集南雄府始兴县、韶州府翁源县两地白莲教徒数百人，开始发动武装造反，并分兵到处杀害富商祭旗鸣金，又出兵攻打南雄府附近县城，声势甚大。
受到了广东承宣布政使司南雄府官员重视，集结好乡兵进行镇压，王子龙被抓斩首，妖僧李圆朗则在4月初9日，被明督察院右都御史兼南赣巡抚：秦耀，俘虏五马分尸。
4月20日，明兵部尚书：赵焕，根据明都察院左佥都御史兼福建巡抚：周寀，的建议以福建承宣布政使司漳州府沿海居民贩海通倭寇为由，规定东、西二洋，各派船只四十四艘，不得超过限额。
6月初6日，北直隶河间府沧州、静海县、吴桥县，一带运河地区刮起大风，漕船互击淹溺二十三人，失去漕米三千一百五十七石。
同时明云南巡抚：萧彦，调集云南都指挥使司的滇军以及土司兵，对叛军进行围剿，于6月11日彻底平定，明楚雄府副总兵：邓子龙，也因此被调去广西承宣布政使司。
9月17日明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，在解决了建州女真栋鄂部问题之后，因有栋鄂部首领：栋鄂·何和礼，前来率部投降，再加上建州女真苏完部首领：瓜尔佳·索尔果、建州女真雅尔古部首领：佟佳·扈尔汉，均率部来降使得建州左卫军民指挥使司兵力大增。
当即决定厚待来投诸部女真首领，对苏完部首领：瓜尔佳·索尔果，长子：瓜尔佳·费英东，授封为「一等大臣」在把台吉：爱新觉罗·褚英，长女：爱新觉罗·东果，许配给栋鄂部首领：栋鄂·何和礼，在收雅尔古部首领：佟佳·扈尔汉，为养子赐姓〈觉罗〉。
并在孙女婿栋鄂部首领：栋鄂·何和礼，的挑拨离间之下让明建州左卫军民指挥使借着回师之际，趁机攻打王甲城灭了建州女真完颜部，以报自己灭族之仇。
就这样建州左卫军民指挥使司开始转而回师，进去了王甲城地区，建州女真完颜部首领：完颜·荪扎秦光衮，得知好友归来，自然是毫不犹豫地下令开门迎接。
因此建州左卫军民指挥使司军队进城之后，随之而来的便是气势汹汹地栋鄂女真部军队，慌乱之时建州女真完颜部首领连忙布置城防，以及下令关闭城门。
还祈求建州左卫军民指挥使帮助他对抗外敌，谁知明建州左卫军民指挥使却要他投降献城归顺。
眼看城下栋鄂女真部军队攻城很急，由不得他考虑太多！情急之下建州女真完颜部首领便答应了要求。
这下明建州左卫军民指挥使才在城楼上面示意停止攻城，仅仅只是捆绑了完颜·戴度墨尔根，作为双方各退一步的筹码斩杀。
此时建州女真三卫的八个部落，还有鸭绿江流域的朱舍里女真部、纳殷女真部，尚未被攻克。
这使得明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，从之前的建州女真左卫淑勒贝勒改尊称为〈聪睿贝勒〉等级上升几倍。
10月初9日，明孟养军民宣慰使：思威，死去后，朝廷任命他的长子：思远，为孟养军民宣慰使。
次日缅军得知消息便进军孟养军民宣慰使司，攻破孟拱城，明孟养军民宣慰使：思远，连忙带领族人逃入盏达付宣抚使司。
11月18日缅军又攻破孟密宣抚使司管辖的孟广城，明孟密宣抚使：罕洪，被迫逃入陇川宣抚使司，又被缅军追击进攻陇川宣抚使司，好在及时被明军击退。
12月初7日年刚刚统一了安土桃山幕府的，关白：丰臣秀吉，听信了安土桃山幕府萨摩国藩主兼左近卫中将：岛津义弘，的一面之辞，使他先前认为的琉球中山王国属于安土桃山幕府附庸国的信念更加坚定了。
居然贸然遣使去琉球中山王国，要求大明琉球中山郡王大金武王子：尚永，派遣使臣向安土桃山幕府祝贺，在趁机宣扬自己的武力强大，
但是很不幸由于琉球中山郡王大金武王子病故的消息，还未传出去外界，又加上继承人是他的女婿琉球中山王国小禄御殿兼蒲添王子：尚宁，故此在带孝期间琉球中山郡王大金武王子长女琉球中山王国阿应理屋惠按司加那志：尚兰丛（尚宁夫人）次女琉球中山王国闻得大君加那志：尚月岭，都是守在灵位旁。
而到达琉球中山王国内的安土桃山幕府使者们，也不好在这时候灼灼逼人，因此这事就这样被暂时搁置了，但迫于强邻的强大，嗣位的大明琉球中山郡王蒲添王子：尚宁，却不敢轻易得罪安土桃山幕府。
12月21日，明大理寺左评事：雒于仁，上奏道“臣入京以一年有余，只有三次见到陛下，此外惟听说陛下身体欠安！拜天地祭祖宗，往往遣官代往，政事不亲理，圣学久停不讲，臣由是知陛下之病，药物难攻，只有臣的四箴可治，陛下之病在酒、色、财、气，臣闻嗜酒则腐肠，恋色则伐性，贪财则丧志，尚气则戕生，陛下白天美酒佳肴仍嫌不足，继以长夜作饮，此其病在嗜酒，宠十小阉，溺爱郑皇贵妃，言听计从，斥逐忠谋，不立东宫，此其病在恋色，不断征索库银，括取币泉，以至拷讯宦官，献上金银珠宝则已，否则便发怒切责，此其病在贪财，喜怒无常，今日打宫女，明日鞭挞阉人，罪状未明，立死杖下，积怨怒于直臣，一屈不申，赐死无日，此其病在尚气，四病绞绕身心，岂药石所可治，今陛下春秋鼎盛，犹长期不视朝，今后更当何如？陛下有此四病，不说是操生杀之权，人畏之而不敢言；则说是身居深宫九重之地，人莫知而不能言。保禄贪生之士，害怕威权；怀忠守义之人，何避釜锯！臣今日特撰四箴，劝陛下戒嗜酒，戒恋色，戒贪财，戒尚气，若陛下肯用臣言，即使立诛臣身，臣虽死犹生。”
这份奏折呈上去之后，明神宗看后非但不思己过戒除四病，反而大为震怒，罢雒于仁为庶民。
明万历十八年公元1590年正月初1日，身穿冕服十二章的明神宗：朱翊钧，驾御毓德宫内，召集内阁辅臣们全部觐见。
明神宗为了向群臣表示，故此牵着明皇长子：朱常洛，的手，用以说明他们父子两人的关系很融洽，并没有废长立幼的意思，大臣们见状连忙跪拜。
于是就趁机手谕各位大臣，说道“伦序已定，朕何敢因私？特以皇长子羸弱，待十年后，大典并行。”
正月初4日，身在大明帝国辽东都指挥使司关外寒冷地区的建州左卫军民指挥使司，行驶出来一队建州女真左卫使者前往辽东都指挥使司。
这次负责带队的不是别人，而是明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，他在向明辽东总镇总兵兼太子太保：李成梁，进献完礼物，之后便以朝贡使的身份带领108人的大朝贡团进京。
他们赶着马车里面满载；人参、貂皮、猞猁狲皮、东珠、海东青，等关外名贵土特产，排成长长的队伍沿朝廷规定路线经辽东都指挥使司抚顺守御千户所、沈阳中卫、东宁卫、海州卫、广宁右屯卫、广宁中屯卫、宁远中左备御千户所、宁远卫、宁远中右备御千户所、宁远中后备御千户所、广宁中后备御千户所、广宁前屯卫、广宁中前备御千户所。
在进入山海卫过北直隶永平府永平卫、顺天府蓟州卫、通州右卫，最终到达帝都京师外城。