武则天登基前的神秘浮屠与命案
在大唐盛世，武则天（刘嘉玲饰）即将登上皇位之前，她下令修建了一座高达三百尺的通天浮屠。这座宏伟建筑不仅是对她的权力和威严的象征，更是她心中宏图大展的体现。然而，在浮屠竣工前夕，一系列诡异而令人胆寒的事件悄然发生。工部侍郎贾颐和大理寺卿薛勇（刘金山饰）相继离奇自焚身亡，一时间朝野震惊。
监工沙陀（梁家辉饰）面对接连不断的死亡，神色凝重地向众人解释，称这两人因触碰了通天柱上的灵符，因而遭到了上天的惩罚。这一说法迅速在民间流传开来，人们开始将这些不幸归结为神灵的怒火，整个长安城笼罩在一片阴霾之中。与此同时，武则天意识到事态严重，必须尽快查明真相，以稳定民心和朝局。于是，她命令大理寺少卿裴东来（邓超饰）和自己最信任的贴身侍卫上官静儿（李冰冰饰）着手调查此事。
狄仁杰奉命出山
就在调查陷入僵局之际，国师陆离却提出了一个不同寻常的建议。他认为，唯有狄仁杰（刘德华饰）才能揭开此案背后的真相。狄仁杰曾是朝廷中最为出色的断案高手，但因种种原因入狱八年之久。如今，武后下旨赦免了他的罪行，并任命他为钦差大臣，负责调查这两起离奇命案。消息传出后，各方势力蠢蠢欲动，暗中布下了重重杀机。
当狄仁杰走出牢房时，他深知此行凶险万分。果然，刚一出狱便遭遇了刺客袭击。然而，狄仁杰早已做好充分准备，不仅随身携带了各种防身武器，还得到了上官静儿的贴身保护。经过一番激战，他成功摆脱了追杀者，安全抵达临时住所。此时此刻，狄仁杰明白，这场阴谋背后隐藏着更深层次的秘密，而他必须全力以赴，方能拨开迷雾，找到真相。
初步排查与琅琊王的邀约
狄仁杰首先对案件进行了细致分析。通过现场勘查和对相关人员的询问，他逐渐排除了一些显而易见的嫌疑对象。其中，琅琊王李宵（姚橹饰）引起了狄仁杰的高度关注。作为一位颇具影响力的宗室成员，李宵一直对武则天掌权心存不满，试图寻找机会推翻她的统治。因此，狄仁杰决定与李宵进行一次面对面的交谈，以确认其是否与此案有关联。
在一次秘密会面中，李宵毫不掩饰自己对武则天的敌意，甚至直接邀请狄仁杰加入反对派阵营，共同对抗武后的统治。然而，狄仁杰深知当前局势复杂多变，贸然参与任何一方都可能带来不可预见的风险。于是，他婉拒了李宵的好意，并表示自己只会专注于调查真相，不会卷入政治斗争之中。李宵虽感失望，但也未再强求，只是警告狄仁杰要小心行事，因为敌人无处不在。
赤焰金龟之毒与鬼市探秘
随着调查深入，狄仁杰发现了一个关键线索——两名死者身上均带有赤焰金龟之毒。这种剧毒源自西域，极为罕见，普通人根本无法获得。为了进一步了解此毒的来源及作用机制，狄仁杰决定前往鬼市寻求答案。鬼市是一个藏匿于长安城角落的黑市交易场所，这里汇聚了来自各地的奇珍异宝、稀有物品以及非法交易。
夜幕降临，狄仁杰带领裴东来和上官静儿悄悄潜入鬼市。他们四处打听，终于找到了曾经担任太医的汪驴。汪驴是一位饱经沧桑的老者，虽然已经远离官场多年，但对于各种药物依然有着独到见解。狄仁杰向他详细描述了死者的症状，并展示了从尸体上提取的毒物样本。汪驴仔细观察后，确认这是一种极其罕见的赤焰金龟之毒，并透露只有极少数人能够掌握这种毒药的制作方法。
正当三人准备离开时，突然遭遇了一群杀手的围攻。显然，有人不希望他们继续追查下去。在这危急时刻，国师陆离的身影若隐若现，仿佛在幕后操控着一切。面对突如其来的袭击，狄仁杰等人不得不奋力反击。凭借高超的武艺和默契配合，他们暂时击退了敌人，但形势依旧不容乐观。此时，狄仁杰意识到，真正的幕后黑手尚未现身，而他必须更加谨慎地应对接下来的挑战。
案情渐明与新的线索
经过一番苦战，狄仁杰等人终于摆脱了杀手的纠缠。尽管身体疲惫不堪，但他们并未放松警惕。回到住处后，狄仁杰立即对刚刚获取的信息进行了梳理。他发现，赤焰金龟之毒的使用并非偶然，而是经过精心策划的结果。根据汪驴提供的线索，这种毒药通常用于暗杀重要人物，且使用者往往具有极高的身份地位。结合此前了解到的情况，狄仁杰推测，此次命案很可能与宫廷内部的权力斗争密切相关。
为了验证自己的猜测，狄仁杰决定从其他角度入手，寻找更多证据。他重新审视了两位死者的背景资料，发现他们在生前都曾参与过一项重要的工程——通天浮屠的建设。特别是工部侍郎贾颐，作为该项目的主要负责人之一，他对浮屠的设计和施工细节了如指掌。由此，狄仁杰怀疑，浮屠本身或许隐藏着某些不为人知的秘密，而这些秘密正是导致命案发生的根源所在。
带着这一想法，狄仁杰再次来到通天浮屠施工现场。此时，浮屠已接近完工，巨大的塔身直插云霄，气势恢宏。然而，在这壮观景象的背后，却弥漫着一股压抑的气息。狄仁杰仔细检查了每一处细节，最终在一个隐蔽角落发现了几枚奇怪的符文。这些符文与监工沙陀提到的“通天柱之灵符”十分相似，似乎暗示着某种神秘力量的存在。
国师陆离的谜团与真相初现
随着调查的不断深入，狄仁杰越来越感到困惑。国师陆离始终徘徊在案件边缘，看似置身事外，却又在关键时刻给予指点。他的真实意图究竟为何？难道他真的是幕后主使？还是另有隐情？
一天深夜，狄仁杰独自一人来到皇宫外的一片树林中冥想。就在此时，陆离悄然出现在他面前。二人相对无言，空气中弥漫着一种难以言喻的紧张气氛。良久之后，陆离终于开口说道：“你所追寻的答案，其实并不远。”
狄仁通天浮屠的建造初衷是为了彰显武则天的权威和智慧，但在其设计过程中，却意外触及了一段被尘封的历史。原来，早在数百年前，这里曾发生过一场惊心动魄的战争，无数英灵在此陨落。为了平息怨念，当时的工匠们在浮屠底部刻下了镇压邪恶的符文。然而，随着时间流逝，这些符文逐渐失去了效力，反而成为了引发灾难的导火索。
得知真相后，狄仁杰陷入了沉思。他意识到，要想彻底解决此案，就必须找到一种方法来修复那些被破坏的符文，恢复其原有的功能。同时，他也明白了国师陆离之所以如此神秘莫测，是因为他一直在暗中守护着这段历史，防止其再度被人利用。
最终对决与正义的胜利
经过深思熟虑，狄仁杰制定了一个周密的计划。他联合裴东来和上官静儿，趁着夜色潜入通天浮屠内部，寻找修复符文的关键物品。一路上，他们遇到了重重阻碍，包括机关陷阱和守卫的阻拦。但凭借着各自的智慧和勇气，三人最终突破重重防线，来到了浮屠核心区域。
在那里，他们发现了一块散发着幽光的玉石。这块玉石正是修复符文所需的最后一道材料。正当狄仁杰准备将其取出时，一群黑衣人突然出现，企图阻止他们的行动。为首的正是那位一直隐藏在暗处的国师陆离。原来，陆离的真实身份是一名古老的守护者，他肩负着保护这段历史的重任。然而，随着时间的推移，他也逐渐迷失了自我，甚至不惜采取极端手段来维护所谓的“平衡”。
面对陆离的攻击，狄仁杰并没有选择正面交锋，而是试图说服对方放下执念。经过一番激烈的辩论，陆离终于醒悟过来，意识到自己的行为已经偏离了初衷。最终，在狄仁杰的帮助下，陆离放下了心中的包袱，与众人一起完成了符文的修复工作。
随着符文光芒重现，通天浮屠周围的阴霾逐渐散去，原本混乱的局面也得到了控制。狄仁杰成功揭开了案件背后的真相，不仅为无辜死去的人们讨回了公道，也为大唐王朝带来了一丝安宁。而他自己，则继续踏上了新的征程，继续用智慧和勇气守护这片土地上的每一个生命。