朱少龙穿越成天启帝朱由校，他心想：“我是大学生穿越而来，穿越之前读历史书时，也很敬佩闯王李自成，但是现在我穿越成了皇帝朱由校，从他历史上攻入北京城所干的那些丑事，我认清了李自成救不了华夏民族。只有我朱由校，想把明朝建成一个安定繁荣的社会。李自成很快会引导农民起义，制造明朝社会的巨大动乱。他现在和朕是敌对的，朕必须要杀伐果断，用铁血手腕杀死他。”
现在，李自成因妻子韩金儿与他人通奸之事愤而将韩金儿杀死，此举被外界解读为因奸情而杀妻。然而，延安府的艾同知秉持公正，认为捉拿奸夫奸妇需双方一并捉拿，要捉奸拿双，而李自成只是有杀妻之实，并没有抓住奸夫。因此对李自成施以二十杖责之刑后，再将其下狱等候处理。
二十杖责，打的李自成皮开肉绽。
朱由校下了一道密旨：让延安府艾同知关押好李自成，绝不能将其放走。因为李自成杀了他的妻子韩金儿，这是不可赦免的罪行。
同时，朱由校又传圣旨，命令孙传庭带领军队，在延安府监狱附近设好埋伏。
朱由校要让李自成死得其所，给他一个最合理的死法。
与此同时，朱由校命令锦衣卫高手，在延安府大牢扮成狱卒，设下天罗地网，只等李自成自己找死。
机会很快就来了，一个深夜，一队黑衣人，足足有一千人，他们是来劫狱，想救出李自成。
“杀进去，救出李自成！”为首的黑衣人喊道。
“杀！”其他黑衣人纷纷响应。
这正好落入了朱由校布置好的天罗地网，李自成刚被救出大牢，锦衣卫扮成的狱卒不仅武艺高强，还用枪支射杀这些黑衣人。
“砰砰砰！”枪声响起，黑衣人纷纷倒地。
“啊！”李自成发出了惨叫声，身中数十枪，倒在了血泊中，终结了他的生命。
“不好，有埋伏！”为首的黑衣人喊道。
“杀！”孙传庭带领军队，强势围剿这些黑衣人。
“啊！啊，哎哟……”黑衣人发出惨叫声，纷纷被杀死，最后，这些劫狱的黑衣人，全部被杀死，没留下一个活口。
“信王，李自成已死，黑衣人也全部被剿灭。”孙传庭向信王朱由检禀报。
“很好，皇兄的妙计已经成功，他要让天下人知道，反贼的下场只有死路一条。实在是痛快啊，李自成这贼子，前世我斗不过他，今生这么轻易就把他杀了。”朱由检满意地说道。
孙传庭按照朱由校的旨意，贴出延安府告示：“皇恩浩荡，在陕西进行扫黑除恶抓土匪，意欲打造治安环境最好的陕西，刁民李自成，身上背负杀妻人命案，不知反省，买通土匪帮忙，逃出大牢，今已被陕西捕快，将其击毙，特此公告，以敬效尤。”
老百姓们拍手称快，怒道：“皇帝狠抓陕西治安环境，李自成行凶杀妻后，还敢顶风作案，勾结土匪越狱，真是该死。”
百姓王厚勇道：“他本就犯了大罪，现在还敢越狱，真是不可饶恕！”
百姓张大牛道：“这种人就该杀，活着也会是危害治安的一颗毒瘤！”
未来第二代大名鼎鼎的闯王李自成，未来的大顺政权的大顺皇帝。就这样轻易的被朱由校把他杀了，杀的有理有据，他死的一点都不冤。
孙传庭的奏章，到了朱由校的御书房，朱由校得知了李自成已死的消息。朱由校的心中有一点矛盾的想法。他知道自己杀了一个有潜力的对手，这一杀，让明朝廷和李自成长达15年的内战，不可能再发生，这对天下百姓来说，是一件大好事，免受战乱之苦。对大明朝廷来说，也省掉了应付内战的财政开支。但同时他也感到一丝内疚，历史上的李自成，毕竟做过一回英雄，现在早早的将他杀了，他连英雄也做不成了。
“皇爷，李自成已死，现在陕西的治安环境得到了极大的改善，百姓们都对陛下感恩戴德。”锦衣指挥使张安说道。
朱由校说道：“朕知道了，孙爱卿做得很好，朕要好好奖赏他。你的情报工作也做的很好，朕不会亏待你。”
张安连忙跪地谢恩：“陛下隆恩，臣无以为报，唯有尽忠职守，为陛下效力。”
朱由校笑了笑，说道：“张安，你起来吧。朕知道你忠心耿耿。”
张安起身，说道：“皇爷，李自成虽然已死，但其它的余孽还在，皇爷不能掉以轻心。”
朱由校说道：“朕知道，朕会给孙传庭密旨，一个个的杀掉这些余孽，朕要以史为鉴，对这些人的处理，要杀伐果断。”
张安说道：“陛下英明。”
朱由校坚信：“自己的做法是正确的，只要朕能够让明朝走向安定繁荣，就是早早杀了李自成，也是对的。李自成，一位明末农民起义领袖，他初期的英勇与后来的失态形成鲜明对比。他早期受到高人指点，以“均田免粮”为口号，为农民的权益而战，赢得了众多农民的敬仰与拥戴，被誉为农民的英雄。然而，随着权力的膨胀，李自成的行为逐渐偏离了初衷。
李自成称帝之后，他沉溺于搜刮财富与美女，纵容部下肆意烧杀抢掠，侮辱妇女，致使百姓再次陷入水深火热之中。在政治上，他未能妥善管理国家，对部下的放纵导致民心涣散。这些过失最终导致了他的失败。因此，李自成既是明末农民起义的英雄，又是历史的千古罪人。”