此后连续几天，内阁诸人求见都被朱由检给推掉了。现在的朱由检虽然轻松了很多，但是事情也不是少。
其班底初成:
皇家学院由徐光启负责，负责统管各专业事务，新的医学科的架子也在搭建中，还兼粮种的改良，
兵工厂由孙元化，陈于阶负责，改良与制作枪械并行，
后勤由侯恂负责，
皇庄现在由宋献策负责，
商行由巩永固和刘文炳负责，
新军由卢象升统领禁卫军第一军，经过短暂的三天假期之后也在继续加紧训练，准备入陕事宜。
孙传庭负责的新二军正在快速成军，
东厂由曹化淳负责，
锦衣卫由田尔耕，李若链负责，两个机构一明一暗，势力正在从京师向地方重新整顿扩展之中。
大明时报，各地税监账目都由王承恩负责。
各部职能虽然明确了，每天上报的要处理的事情也多了起来。朱由检目前还需要操心军事学校的事情，各地方的情况虽然他这个皇帝也管不到，但是每日的奏报还是有的，内阁递上的条陈也要批复。目前军事，校筹建速度很快，经过商讨，正式名称定为大明皇家武官学院，地点设在保定，第一批生员对象已经确定从今年的武举中录取，另，新军底层军官也要定期接受培训。如今各人都处在忙碌之中，朱由检自然也没时间闲着。
内书房，王承恩，田尔耕，李若链，曹化淳都在。
“王伴伴，你这段时间辛苦了，由管宫内又管宫外，着实辛苦，朕准备在考察一段时间，差不多的话就把内帑的事务交由侯恂去做，王伴伴则专门负责勘察核对就行。宫里的事朕还是只放心你来做，所以啊，你这工作重心还是要放在宫里面的。”朱由检放下刚看完的条陈，边批复边说道。
“皇爷说的是，老奴全听皇爷安排。”王承恩无可无不可的说道。对于王承恩来说，陪在皇帝身边才是正事，其他的事都可有可无，万一给自己派远了去，和陛下疏远了反而得不偿失。
“嗯，曹公公，东厂那边现在怎么样了？”朱由检若有所指的说道。
“回皇爷，东厂目前已经开始往地方开始重新布置爪牙，对官员的监察也没放松，前两天刚刚处理十来个北边鞑子派来的细作。”曹化淳躬身说道。然后话音一转
“还有就是各部矿监的纠察也开始了，皇爷的意思老奴也传达出去了，目前派驻各地的银监，矿监，监军等都已派发召令，不日将全部召回京师整改，新一批的人也都是从内书堂，哦不，从皇家学院选派的，人员已经陆续赶往各地了。目前京师周边地区的已经大部分回来了，差不多有百十人，正在进行纠察，主动上缴的赃款目前已达八十余万两。老奴这边对主动交代的一批人决定再勘察一番，若无虚报隐瞒，则从轻发落。按皇爷的意思，送至皇家学院学习改造后再派往其他部门。具体审讯材料老奴之前已经呈送于皇爷御前了。”
“嗯，曹公公办事效率很高，朕心甚慰。功劳先给你记着，等事情办完了再赏。”朱由检说道。听到有钱进账了，心情好了不少。随即面向田尔耕问道:
“锦衣卫这边怎么样了？”
田尔耕弯腰行礼，说道:
“回陛下，锦衣卫京师部分已经整顿的差不多了，目前所有荫官人员已经全部废弃，内部考核也在不断进行之中，能者上，庸者下，对在京重要人员的府邸渗透任务正在进行中，原有的上下线也全部重新调整，相关事务臣已经写成奏疏呈于陛下，请陛下御览。另臣已经将前日黄之极与施鳯来密会内容详细内容已经记录，呈于陛下。
目前锦衣卫正在向地方扩展、梳理之中，辽东方面的锦衣卫目前已全部由许显纯负责，只是人手缺额比较大，新人也在陆续招募中。然而北镇抚司经费已然不足，臣请陛下调拨经费…”
“嗯，很好，锦衣卫和东厂是朕的左膀右臂，尔等需用心用力去做，朕不想变成残废。”朱由检说道。
“请陛下放心，臣等愿为陛下效死。”众人说道。
“诸位忠心朕知道了，朕这段时间梳理了一下，感觉东厂和锦衣卫职能冗杂，多有重复，朕欲重新规划一下，你们帮朕也参谋参谋。”朱由检这时候说道。