4月20日，保定清苑义和团与教民大规模械斗，“拳民与教民各聚多人，竟自械斗，势甚凶猛“。
5月12日，保定涞水义和团与教民大规模械斗。
5月22日，义和团戕杀前来平定械斗的清军将领杨福同。
5月27日，数万义和团进入距北京仅有五十多公里的涿州，之后攻打涿州和北京之间铁路沿线的车站、桥梁及电报设施。
5月29日，义和团焚烧北京近郊的丰台车站。车站、车厢、商店、太后专列全部被烧。
5月31日，在清政府同意下，337名外国水手及陆战队员登岸，乘火车于当晚抵京，一说6月1日抵京，防卫使馆区。另外89名德国及奥国陆战队员于6月3日抵京。
6月7日，在清廷许可之下，大批拳民开始进入北京。
6月10日，慈禧委派端郡王载漪出任总理各国事务衙门大臣。越来越多的义和团拳民陆续进入北京，最多时北京的拳民超过十万。是日起，北京东交民巷外国使馆区对外通讯断绝。
6月11日，日本驻华使馆书记杉山彬在永定门内被刚调入京的董福祥甘军所杀，被开腹剖心。驻天津的各国领使组织二千人的联军，由英国的海军司令西摩尔带领，乘火车增援北京十一国公使馆。因为铁路被拳民破坏，西摩尔受阻于天津城外的杨村、廊坊一带，与清兵及义和团展开战斗不利，退回城中，致使第一次试图解除清兵和义和拳民对公使馆的围困失败。该战事是一次抗击外敌的重大胜利，并被命名为“廊坊大捷“。
6月13日，义和团进入内城，当天烧毁孝顺胡同亚斯立堂、双旗竿(今外交部街西口外)伦敦会、八面槽(王府井)天主教东堂、灯市口公理会、东四五条西口的美国福音堂、交道口二条长老会、鼓楼西鸦儿胡同长老会、西直门内天主教西堂、西四羊肉胡同基督教堂、石驸马桥安立甘会、宣武门内天主教南堂共11所教堂。有3，200名天主教徒逃入(有42名法兵保护)天主教北堂，2，000多名基督教徒逃入东交民巷的使馆区。拳民在北京放火烧掉教堂和一切与西洋有关的事物。
6月15日，军机处曾一度传旨，令在任两广总督的李鸿章，及山东巡抚袁世凯速入京。
6月16日，义和团烧毁前门老德记西药房，而附近约千家商铺受波及而被烧成废墟，正阳门楼、北京24家铸银厂也遭烧毁。拳民同时四处破坏教堂攻击教民，庄王府前大院被当成集体大屠杀的刑场。除了屠杀教民外，义和团更滥杀无辜，诬指许多市民(包括许多妇女小童)为白莲教而烧死戮死，如据当时目击者记载:“乡民适趋市集，七十余人悉絷以来;伪饰优伶冠服儿童戏物，指为白莲教;下刑部一夕，未讯供，骈斩西市。有妇人宁家，亦陷其中，杂诛之，儿犹在抱也“也有被公报私仇而杀者，如扶持义和团的庄亲王载勋、端郡王载漪的好友副都统神机营翼长庆恒一家大小十三口因被寻仇于七月初被全部杀害。而义和团民的不同派别也互相武斗残杀。义和团、京师禁军和甘军也肆意奸杀妇女，不计其数。除了屠杀奸淫外，义和团及清军也掳掠洗劫商户平民，并将赃物公开拍卖。当时的权贵之家也不能幸免，如吏部尚书孙家鼐、大学士徐桐的家都被抢掠，徐桐(时年八十)更被义和团民拖出批斗。是日慈禧召开御前会议后，一度发出勒令解散拳民的上谕。(出处不明)
6月，山西义和团焚烧教堂，山西巡抚毓贤登高望到火光称“天意也“并禁止清军救火，有英国教士逃出，对群众说“昔晋省大(旱)，吾输财五六万，活数千人。今独不能贷一死耶?“被清军杀害。一英国妇女抱着儿子跪下，说她施医每年救活数百人，请求饶过她和儿子。被士兵击倒，和儿子一起推入火中活活烧死。7月，毓贤派士兵守太原城门，禁止教士出入，又将教士老幼囚禁在铁路公所。7月9日，毓贤将这几十名教士及其家属妇孺押至抚署，杀害英国教士及家属男女老幼三十馀人及仆役二十馀名，枭首示城门，剖心弃尸，积如丘山。又驱赶法国天主堂修女二百馀人，至桑棉局，迫令背教，皆不从。毓贤下令斩为首二人，令修女饮两人的血，有十六人将血饮下。毓贤下令将这十六人?悬高处，迫其他人背教，皆不从。清军士兵又掠走貌美的修女几十名，但都不屈，最后全被杀害。(出处不明)
6月20日，德国驻华公使克林德代表各国前去总理衙门要求保护，途中被清兵伏击(由于克林德曾经枪杀义和团众，此次行为被认为是报复);成为列强发动战争的借口。
6月21日，按照慈禧太后的旨意，清政府以光绪皇帝的名义，向“彼等“(并未列出“英、美、法、德、意、日、俄、西、比、荷、奥等十一国“)同时“宣战“。实际上皇室只曾向清室臣下下达一份谴责洋人和表达决心的诏书，而该诏书未曾按现代外交惯例，交予外国使节。
清廷向各国宣战的同时，也悬赏捕杀洋人，规定“杀一洋人赏五十两;洋妇四十两;洋孩三十两“。义和团及朝廷军队围攻各国在北京的使馆。使馆区内被围人数约3，000人，当中约2，000为寻求保护之华人;400人为外国男性平民，147名妇女及76名小童。另有士兵、水兵及陆战队共409人，武装有3挺机枪及四门小口径火炮。各国在准备以武力解救使馆的同时，各使馆筑起防御工事，由英国公使窦纳乐负责指挥抵抗。
6月25日，在载漪、载勋、载濂、载滢四兄弟的率领下，义和团一行六十多人直奔瀛台欲弑光绪帝，被慈禧太后阻止而未果。
事件最终演变为国际军事冲突，在事件平息之前，约有45，000名来自日本、美国、奥匈帝国、英国(英军中包括英在威海卫训练的由中国人组成的中国兵团)、法国、德国、意大利及俄国的八国联军以及剿灭拳乱的清廷军队与义和团拳民对战。7月至8月进军北京的联军指挥官是俄国人General Linevitch。
6月27日，许景澄及袁昶联衔上奏，请杀主战派，而再后杀两人以谢主战派。
7月14日，联军占领了天津;直隶总督裕禄兵败后自杀。
7月28日，主和的大臣许景澄及袁昶被清廷处死。
8月4日，联军向北京进逼，沿途并没有遇到真正有力的抵抗。当时沿途的清兵和义和拳民估计有15万之多，而联军总数开始时仅3万多人(后来有所增加)。时值8月，气候炎热而潮湿，加上沿途浓密的玉米地形成天然屏障，为进军增添了种种困难。
8月11日，清廷处死主和的大臣联元、立山及徐用仪。此三人与之前被杀的许景澄、袁昶号称庚子被祸五大臣。
8月14日凌晨，联军自通州攻打北京，董福祥率军在广渠门与英国军队作战，下午2时，广渠门被攻占，董后撤至东便门、朝阳门、正阳门一带继续抵抗，禁军溃败。董福祥从彰仪门撤走，撤走时纵兵抢掠。
8月15日，慈禧携光绪帝等皇室仓皇西逃，10月26日抵达西安。
8月16日晚，八国联军已基本占领北京全城。
义和拳运动的结果之一是朝廷体制内的守旧顽固派被清除，因而在1901年清政府延续戊戌变法的思潮，启动了一场政治体制改革--新政，以求避免清朝灭亡。
在中国仕绅阶级看来，清政府在事件中对联军势力无能为力，统治威信大幅下降。东南各省总督在事件中擅自违令行动，事后反而得到褒奖。各地督抚开始出现不受中央控制的政治意向，统一集权的态势开始解体。十年后，南方革命党反政府的活动激进化，团结各省新军于1911年武昌爆发辛亥革命，南方各省直接违抗清政府自行宣布独立或观望。最终袁世凯进逼清帝退位，中华民国得以肇建。而地方政治实力上升所造成的割据局面，导致民国军阀混战的政局。
俄国乘机占据了大量中国东北(或称满洲)的领土。俄国对辽东的租界得到承认。俄国的行动威胁英美所希望维持的中国的领土完整及贸易开放(门户开放)政策;并最终与在辽东和满洲东部省份希望扩展势力范围的日本冲突。经过两年的谈判，最终双方关系破裂并在1904年2月爆发了惨烈的日俄战争。
根据辛丑条约，日本可以在中国一部分地区驻军，保护侨民和交通路线，这为日后的中日冲突埋下了祸患。
义和团事件亦改变了列强的对华政策，减缓了当时列强殖化中国的步伐，正如当时谚语所讲:“老百姓怕官，官怕洋鬼子，洋鬼子怕老百姓“。列强意识到利用虚弱不堪的清政府统治中国百姓，显然比列强直接派总督统治百姓有利。